基孔肯雅病毒 nsp1 和 nsp2 基因假病毒标准物质可作为测量标准,可用做从核酸提取到实时荧光定量 PCR 方法定量测定基孔肯雅病毒核酸全流程的测量标准,还可用于检测方法的验证和实验室质量控制等领域。
一、样品制备
本标准物质是通过将基孔肯雅病毒非结构蛋白 nsp1 和 nsp2 基因(基因组坐标:1-2894,GenBank No. KJ941050.1)合成质粒,然后包装得到假病毒颗粒,经过稀释至一定浓度分装。
二、溯源性及定值方法
采用经国际比对验证的同位素稀释质谱法对逆转录效率修正的逆转录数字 PCR 方法对 nsp1 基因进行拷贝数浓度测定,得到标准物质的标准值。通过使用满足计量学特性要求绝对定量测量方法和经检定校准的容量计量器具,确保本标准物质的量值溯源至可作为任何一个量制基本单位的实体数基本单位“一”(符号:1)以及和浓度的国家法定计量单位摩尔(mol)。
三、特性量值及不确定度
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编号
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名称
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nsp1 基因标准值(copies/μL)
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不确定度(k=2)(copies/μL)
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GBW(E)091400
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基孔肯雅病毒nsp1和nsp2基因假病毒核酸标准物质
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2.9×10^2
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0.9×10^2
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所赋特性量值的不确定度由定值测量、均匀性和稳定性引入的不确定度分量合成得到。
四、均匀性及稳定性评估
参照 JJF1343 国家计量技术规范(等效 ISO 33405),采用数字 PCR 方法对该标准物质进行均匀性检验,结果表明均匀性良好,最小取样量为 140 μL。本标准物质自定值日期起,有效期暂定为1 年,研制单位将继续跟踪监测该标准物质的稳定性,有效期内如发现量值变化,将及时通知用户。
五、包装、贮存及使用
1.包装规格:本标准物质采用 0.5 mL 带内盖彩色冻存管包装,每管 200 μL。
2.保存及运输条件:置于-70°c 冰箱中保存。采用干冰运输,收到后应检查是否处于冰冻状态,检查无误才可用于实验。
3.本标准物质相关实验操作,须在生物安全(BSL)二级及以上实验室,佩戴乳胶手套和防护口罩,在生物安全柜中进行。
4.本标准物质开瓶后一次性使用,不可反复冻融。使用前应先从冰箱内取出,平衡至室温并混匀。
5.若作为质控物质监测采样、提取和扩增过程,可将本标准物质全部转移至采样管中,与待测样本进行相同处理。
6.对提取后的 RNA 进行梯度稀释时,推荐使用 RNA 保存液进行稀释。
7.由于本标准物质包含了基孔肯雅病毒 nsp1 和 nsp2 基因序列片段,请仔细核实使用的 PCR 引物序列所对应的病毒基因组坐标,确保标准物质的量值与其对应。
8.使用后的标准物质包装瓶以及移液器吸头等实验材料应在丢弃前进行高压灭菌。标准物质使用过程中如操作不当,可能会导致实验室环境阳性。